Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1LQ9HCJ6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1LQ9HCJ6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms