Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms