Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB6Q9BUF5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB6Q9BUF5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms