Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms