Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALS2CR12Q96Q35 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms