Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms