Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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