Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GATA6Q92908 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA6Q92908 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms