Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJA4Q8WW22 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJA4Q8WW22 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJA4Q8WW22 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJA4Q8WW22 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJA4Q8WW22 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA4Q8WW22 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms