Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC107Q8WV48 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms