Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms