Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD35Q8N283 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms