Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R42Q7Z4L9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R42Q7Z4L9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms