Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF3Q5SZQ8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms