Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHC1Q5JVL4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHC1Q5JVL4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms