Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms