Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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