Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms