Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCB5Q2M3G0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms