Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NRF1Q16656 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms