Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PDK4Q16654 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PDK4Q16654 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PDK4Q16654 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PDK4Q16654 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PDK4Q16654 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PDK4Q16654 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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