Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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