Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK1Q15118 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms