Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE7AQ13946 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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