Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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