Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALCAMQ13740 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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