Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE3BQ13370 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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