Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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