Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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