Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms