Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms