Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms