Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms