Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS29P62273 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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