Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms