Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52P55327 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52P55327 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52P55327 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52P55327 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52P55327 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52P55327 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52P55327 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms