Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFIP2P53365 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms