Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms