Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CX3CR1P49238 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms