Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT6CP48668 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms