Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCCP43146 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCCP43146 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCCP43146 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCCP43146 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DCCP43146 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCCP43146 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCCP43146 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCCP43146 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCCP43146 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCCP43146 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCCP43146 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCCP43146 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCCP43146 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms