Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ALDH4A1P30038 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH4A1P30038 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms