Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO1P25800 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO1P25800 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO1P25800 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms