Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL1P22362 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL1P22362 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL1P22362 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms