Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD247P20963 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD247P20963 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD247P20963 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD247P20963 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms