Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPN3P20807 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPN3P20807 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms