Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CXCL3P19876 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CXCL3P19876 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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