Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms