Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN1P12814 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms