Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CETPP11597 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CETPP11597 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CETPP11597 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CETPP11597 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CETPP11597 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CETPP11597 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms